Die grenzüberschreitende Zusammenarbeit zwischen den Forschungsteams der VUT und des VIME – Universität Wien ermöglicht die Verbindung von Fachkenntnissen aus den Bereichen Biologie, Informatik und moderner Bildgebungstechnologien. Im Rahmen des Projekts WinOMICs wurde die erste Erprobung einer hyperspektralen Bildgebungsplattform zur Analyse biologischer Proben gestartet.
Im Rahmen eines Treffens der Projektpartner von WinOMICs am Standort VIME – Universität Wien wurden experimentelle Aktivitäten zur Nutzung moderner Bildgebungstechnologien für die Analyse biologischer Proben eingeleitet. Das Treffen stellte einen ersten wichtigen Schritt zur praktischen Verknüpfung hyperspektraler Methoden mit biologischen und OMICs-Daten dar, die im Projekt verwendet werden.
Das Hauptziel bestand darin, einen Pilot-Workflow für den Einsatz einer Line-Scan-Hyperspektralbildgebungsplattform zu entwickeln und deren Eignung für die Bildgebung biologischer Proben zu überprüfen. Während der gemeinsamen Tests diskutierten die Teams der Technischen Universität Brünn (VUT) und des VIME – Universität Wien die technischen Messeinstellungen, die Probenvorbereitung sowie die für die weiteren experimentellen Projektphasen erforderlichen Parameter.
Im Verlauf des Treffens:
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wurde das Konzept der Line-Scan-Hyperspektralbildgebung vorgestellt,
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wurden die grundlegenden Einstellungen des Messprozesses optimiert,
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wurden die wichtigsten Parameter für die Pilotexperimente definiert,
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wurde die Funktionsfähigkeit der Bildgebungsplattform anhand biologischer Proben praktisch überprüft,
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wurden erste hyperspektrale Pilotdatensätze aufgenommen.
Als Ergebnis des Treffens konnte die Funktionsfähigkeit der Hyperspektralbildgebungsplattform für biologische Anwendungen bestätigt werden. Darüber hinaus wurden erste Pilotmessungen durchgeführt und ein Arbeitsablauf für die weiteren Entwicklungsphasen festgelegt. Die gewonnenen Daten werden anschließend zur Verknüpfung der Bildgebungstechnologien mit genomischen, metabolomischen und mikrobiologischen Analysen im Rahmen des Projekts WinOMICs genutzt.
Die ersten Tests der Hyperspektralkamera stellen einen wichtigen Meilenstein bei der Entwicklung des innovativen Projektansatzes dar, der Spitzenforschung, digitale Technologien und nachhaltige Landwirtschaft miteinander verbindet.
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